新冠病毒基因测序，已从专业术语，变成公众熟悉的防疫关键词，这份看似神秘的报告，是怎样生成的，它又怎样精准锁定病毒来源，近日，我们实地探访了青岛市疾控中心，揭开病毒基因测序与溯源工作的完整流程。
实验室：抗击病毒的前沿阵地
步入青岛市疾病预防控制中心的微生物检验科，干净整洁的走廊两边布置着功能不尽相同的实验室，这些屋子配备了核酸提取仪、PCR仪还有二代测序仪等专业装置，它们是开展病毒分析的关键阵地。
全市新冠病毒疑似阳性样本的复核以及全基因组测序任务，是由该科室来承担的。应急检测组表明，所有经由医疗机构或者第三方检测机构上报的阳性样本，都会汇聚到这里。对于关键的病例样本，检测人员会在第一时间启用测序程序。
流程启动：样本筛选与接收
一份阳性样本送达之后，测序流程就正式开始运行。检测人员会先对样本的阳性结果进行再次核对，查看病毒载量是不是达到测序标准。不是所有阳性样本都要测序，一般优先处理首发病例、指示病例以及入境人员等重点样本。
青岛市疾控中心微生物检验科主任汪照国作出解释，第一步是筛选出符合测序条件的样本呀。这保证了后续那些宝贵的测序资源以及时间能够用在最为关键的病例方面，进而为迅速理清传播链奠定基础呢。
核心步骤：捕获病毒遗传物质
样本当中存有大量的人类细胞另外还有其他微生物的遗传物质，新冠病毒的RNA仅仅是其中的一小部分而已。测序的关键处于精准地“捕捉”到目标病毒的基因片段之上。工作人员运用特制的试剂盒，把病毒RNA逆转录成为DNA后用探针将其特异性捕获出来。
这个过程，对于技术的要求，极其之高，就好像要在大海里捞针一样。无论多么细微的污染，还是操作方面的失误，任意一种情况，都有可能致使捕获失败，进而影响到整个溯源结果的准确性。所以，实验人员一定要具备丰富的经验，以及严谨的操作规范。
文库构建：测序前的精细准备
被捕获的病毒基因片段，要经过“文库构建”才可上机测序，这个步骤是把病毒DNA片段化，给其加上特定标签，还要处理成测序仪能识别的格式，整个过程依靠纯手工操作，步骤繁杂且时间耗费长。
因文库质量对最终数据可靠性起着直接决定性作用，这就对操作人员的精度以及熟练度提出了极为严苛的要求。检测组着重指出，构建具备高质量的文库乃是获取清晰且完整病毒基因序列的前提条件，是技术含量处于较高水平的环节当中的一个。
上机测序与数据分析
建好了的文库被放置到测序仪当中，一台设备一回最多能够处理大概100个样本，运行的时间一般需要19至24个小时，机器会自行读取基因序列资讯并产生原始数据，接下来步入生物信息学分析阶段，由专业人士针对海量数据开展拼接以及比对。
分析人员要把碎片化的序列拼接成完整的病毒基因组，接着与已知的数据库进行比对，几个关键突变位点存在着差异，这就能够判断病例是不是属于同一传播链，而这一步为流行病学调查提供了最直接的分子证据。
报告产出与深层价值
当数据分析得以完成后，检测团队将会撰写一份详细的测序分析报告，这份报告将会明确地指出病毒呈现出来的变异株分支，以及其中关键的突变位点，并且还会对其可能存在的传播关联作出推断，要是本地数据库不存在匹配的结果，那么还会与省级、国家级领域的数据库展开比对。
追溯源头并非基因测序意义的全部所在，山东省疾控专家表明，剖析病毒的毒力以及耐药基因，这对于临床治疗方案的挑选具备关键的指导意义，与此同时，青岛已然构建了涵盖本地病毒基因的数据库，为面对未来疫情状况提供了能够进行快速比对的资料储存库。
您有没有感到好奇，在新冠病毒之外，基因测序技术往后的日子里还能够在哪些公共卫生方面起到关键的作用？有没有想法，您可以在评论区域之内跟大家分享您心里头的看法，如果您认为这篇短文对您是有帮助的，那就请点击点赞来进行支持一下。
还没有评论，来说两句吧...